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INRA GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative

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l'Enseignement

Cours du Pr Daniel Gianola sur les méthodes statistiques d’analyse des données génomiques, du 2 au 6 juillet 2012, AgroParisTech, Paris

L'objectif de ce cours est de fournir une formation sur les dernières méthodes statistiques mises au point pour l'analyse de données génomiques. L'accent sera mis sur les approches bayésiennes.

Le cours (en anglais) est principalement destiné aux doctorants et est ouvert aux jeunes scientifiques et scientifiques confirmés.

Programme

1. L'évolution des méthodes statistiques dans la génétique quantitative.
2. Défis de complexité et de l'utilisation de données génomiques
3. Bref examen de l'inférence bayésienne ; régression bayésienne.
4. Prédiction : « BLUP génomique » ; l'alphabet : bayes A, Bayes, B, C de Bayes, Bayes l.
5. Les principes de la validation croisée.
6. Le problème du traitement des interactions.
7. Introduction à la régression non paramétrique : LŒSS, Kern-regression, RKHS, fonction radiale de base, réseaux de neurones (NN).
8. Résultats dans les domaines végétaux et animaux.

D’autres conférences seront organisées : études de cas, des approches étape par étape, rapprochant approche de calcul bayésien pour déduire des réseaux de régulation génique, etc.. Lectures supplémentaires seront données par des jeunes scientifiques et des scientifiques de l'INRA (France).

L'inscription est ouverte jusqu'au 20 juin.

Pour vous inscrire : http://www.egsabg.eu/spip.php?article16

Voir aussi

>>> http://www.biostat.wisc.edu/People/faculty/gianola.htm

Rédaction : E. Verrier - Edition P. Huan
Date de création : 01 Juin 2012
Mise à jour : 04 Juin 2012