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INRA GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative

INRA GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative
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ICE - Iso Cell Express : plateforme de microgénomique expressionnelle
La plateforme ICE possède une expérience solide dans le domaine  de la "Microgénomique intégrative", combinant la microdissection laser (LCM) et la génomique expressionnelle (transcriptome et protéome). Pour ce faire, notre équipe qui a acquis une expertise reconnue dans ce domaine innovant, propose un accès à un ensemble d’instruments à la pointe de la technologie.

L’un des challenges posés aujourd’hui aux biologistes est la capacité à connaître et analyser le génome exprimé par un type cellulaire donné, ce qui suppose de travailler sur de faibles, voire de très faibles, quantités de matériel biologique. ICE est une structure ouverte à vocation principalement locale et régionale (laboratoires publics ou privés) adossée à une équipe de recherche (LGS : Lait Génome & Santé) de l’UMR GABI (génétique animale et biologie intégrative) impliquée dans des programmes d’analyse de l’expression génique. L’originalité de la plateforme réside dans sa capacité à produire et analyser des microquantités de matériel extrait de cellules isolées de leur environnement tissulaire, sous contrôle morphologique, par microdissection laser. La microgénomique requiert des équipements hautement spécialisés et une expertise dans la manipulation de faibles quantités de matériel à analyser. La présence sur ICE de personnels compétents en transcriptomique et protéomique permet d’accéder à un support de haut niveau, à une offre « personnalisée » de solutions intégrées pour la microgénomique et à un éventail de prestations unitaires d’analyse différentielle des biomolécules, en interaction étroite avec les plateformes locales (PAPSSO, CRB et MIMA2). Cette situation offre un cadre privilégié permettant à la plateforme d’assurer de façon dynamique les développements technologiques qui sont ensuite mis à disposition des équipes utilisatrices.
 
Les objectifs de la plateforme sont :
  • Accueillir, conseiller et accompagner les utilisateurs en les aidant à concevoir, réaliser et interpréter des analyses d’expression génétique, au niveau tissulaire et cellulaire, au moyen des technologies les plus performantes
  • Réaliser des formations théoriques et pratiques pour la mise en œuvre des technologies proposées par la plateforme
  • Assurer une veille technologique et mettre à disposition des protocoles testés et validés
 
Les spécificités :
  • Microdissection Laser : capture et/ou cutting (LCM)
  • PCR quantitative en temps réel et TLDA
  • Microgénomique expressionnelle                             

Voir aussi

En savoir plus : https://www6.jouy.inra.fr/ice/
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Rédaction : P. Martin - Edition P. Huan
Date de création : 12 Avril 2010
Mise à jour : 26 Mars 2013